PENDİK COĞRAFYASI41. Paralel dairesindedir. İstanbul 1. meridyen başlangıcı olarak kabul edilirse 15 dakika 5 saniye doğudadır. Kuzey ve batısında Kartal, doğusunda Tuzla, güneyinde ise Marmara Denizi bulunmaktadır.
Akdeniz iklimi görülür. Yazlar sıcak ve kurak, kışlar serin ve yağışı olur. Yılda ortalama 8 gün kar düşer. Sıcaklık yaz aylarında 40°C ye kadar yükselir; kış aylarında -9°C ye kadar düşer. Yıllık nem oranı %70'tir.Kuzeydoğudan esen poyraz ile güneyinde batıdan esen lodos rüzgarlarının tesiri görünmektedir.
Doğal bitki örtüsü, önceleri ormanlık iken şimdilerde çalılık ve fundalıklara rastlanır. Kırsal alanın çoğu makilerle kaplıdır .Bodur maki, süpürgeçalısı, funda, katırtırnağı, kocayemiş ve defne ağaçları vardır. İlçenin kuzeyinde bataklık ormanları yer alır.
Engebeli bir yapıya sahiptir. Ancak yer yer düzlüklere rastlanır (Özellikle denize yakın kesimlerde). Doğal yükseltiler 100m ile 200 m., arasında değişirken Tavşantepe 120 m., Karatepe 190 m. ve Gözdağı 250 m. yüksekliktedir. İstanbul'un en önemli içme suyu kaynaklarından olan Ömerli Su Havzası da bu bölgede bulunmaktadır. Pendik'in %60'ı Ömerli Havzası içinde bulunan bakir topraklardır. Pendik ve çevresinde kalker ve kuvarsit madenleri bulunmaktadır.
| 
